生物資訊學

利用DoubletFinder移除單細胞數據中的雙細胞

單細胞RNA定序(Single Cell RNA Sequencing,scRNA-seq)能夠揭示單細胞基因表達的異質性。然而,這種技術面臨著一個常見的問題,那就是存在雙細胞(Doublets)的干擾。雙細胞是指兩個或更多不同細胞的RNA混合體,其存在會導致基因表達的不準確解讀。因此,我們可以使用 DoubletFinder套件來去除這些雙細胞,從而獲得更精確以及更乾淨的scRNA-seq數據。

6種細胞特徵數據庫 (Cell type annotation database)-查詢細胞類型的好幫手!

自動化判別細胞的套件,只能用於初步判斷細胞類型。如果想要更進一步確認細胞的類型,則需要仰賴研究人員的知識和經驗進行判斷。以下是一些單細胞數據分析常用的特徵數據庫(cell marker database),使用方法都很簡單,只需要輸入特徵基因名稱,就能從數據庫找尋到可能的對應細胞,提供大家參考。
error: Alert: Content selection is disabled!!